Eine Taxonomie (griech. táxis “Ordnung”) ist eine Hierarchie von Begriffen, deren jeder mit mindestens einem anderen durch Hyponymie verbunden ist. Es ergibt sich eine Hierarchie, deren Stufen verschieden umfassend sind. Als Beispiel hier derjenige Teil der Taxonomie der physikalischen Objekte, an dessen Fuß der Vorschlaghammer steht.

Mit Bezug auf eine Taxonomie ist das Hyperonym die Gattung (Genus), das Hyponym die Art (Spezies). Dies sind, anders als in der zoologischen Taxonomie, relative Begriffe. D.h. in einer gegebenen Taxonomie gibt es nicht eine bestimmte Ebene der Gattung und die nächstniedrigere der Art; sondern für jeden Begriff liegt sein unmittelbares Hyperonym auf der Ebene der Gattung, zu dem er selbst eine Art darstellt.

Die Taxonomie ist (vor der Meronymie) die wichtigste Art von Hierarchie.